Η οργάνωση και λειτουργία του ΠΜΣ «Επιστήμη της Μετάφρασης» βασίζεται στις διατάξεις του Κεφαλαίου Θ' - Οργάνωση και λειτουργία Προγραμμάτων Δευτερου και Τρίτου Κύκλου Σπουδών και, ιδιαίτερα, στα άρθρα 79 έως 89 του Ν. 4957/2022, με τα οποία ρυθμίζονται τα σχετικά με τις μεταπτυχιακές σπουδές.
Αρμόδια όργανα για την οργάνωση και λειτουργία του ΠΜΣ στο επίπεδο του Τμήματος είναι: