Η Συνέλευση του ΤΞΓΜΔ απαρτίζεται από τον Πρόεδρο και τον Αναπληρωτή Πρόεδρο του Τμήματος, τα μέλη ΔΕΠ της Συνέλευσης του Τμήματος, έναν εκπρόσωπο των προπτυχιακών φοιτητών, έναν εκπρόσωπο των μεταπτυχιακών φοιτητών και των υποψηφίων διδακτόρων και έναν εκπρόσωπο ανά κατηγορία από τα μέλη ΕΕΠ, ΕΔΙΠ. και ΕΤΕΠ του Τμήματος.

Η Συνέλευση Τμήματος είναι υπεύθυνη για την οργάνωση, διοίκηση και διαχείριση του ΠΜΣ σύμφωνα με τα προβλεπόμενα στο άρθρο 4.1.1 του εσωτερικού κανονισμού λειτουργίας του ΠΜΣ.